南通大學中心校區工程由即將合并組建為南通大學的南通醫學院、南通工學院、南通師范學院三所省屬院校共同建設。中心校區規劃用地2000畝(含省市共建圖書中心用地100畝),三所院校原校區不列入此次規劃范圍。中心校區位于新區核心區東部,北至崇川路,南至嗇園路,西至園林河,東至通富路。建成后的南通大學園區將以自然環境為中心,以東西線展開功能空間的布局形成“一核、一軸、一環、四片、六園、八區”的整體結構框架,并以標志性指導空間為園區核心,主要功能包括圖書館、信息中心,公共教學樓、行政中心、國際交流中心及廣場綠地等;園區內的交通主環路由東、西、中三個子環構成,形成“三環合一環”的道路骨架。